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聚丙烯酰胺凝胶电泳的作用

发布日期:2015-12-15 23:12:58
  作用原理:聚丙烯酰胺凝胶为网状构造,存正在成员筛效应。它有两种方式:非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳(Native-PAGE)及SDS-聚丙烯酰胺凝胶(SDS-PAGE);非变性聚丙烯酰胺凝胶,正在电泳的进程中,蛋白胨可以维持完好形态,并根据蛋白胨的成员量大小、蛋白胨的外形及其所附带的点电荷量而逐步呈梯度离开。
聚丙烯酰胺凝胶电泳的作用
  而SDS-PAGE仅依据蛋白胨亚基成员量的没有同就能够离开蛋白胨。该技能最后由shapiro于1967年构建,他们发觉正在样品介质和丙烯酰胺凝胶中退出离子清洁剂和强复原剂(SDS即十二氢氧基磺酸钠)后,蛋白胨亚基的电泳迁徙率次要起源于亚基成员量的大小(能够疏忽点电荷要素)。
  是阴离子清洁剂,作为变性剂和助溶试药,聚丙烯酰胺生产厂家它能折断成员内和成员间的氢键,使成员去折叠,毁坏卵白成员的二、三级构造。而强复原剂如巯基酒精,二硫苏糖醇能使半胱氨酸残基间的二硫键折断。正在样品和凝胶中退出复原剂和SDS后,成员被解聚成多肽链,解聚后的胆固醇酸侧链和SDS联合成卵白- SDS胶束,所带的负点电荷大大超越了卵白原部分点电荷量,那样就消弭了没有同成员间的点电荷差别和构造差别。
  正常采纳的是没有陆续缓冲零碎,与陆续缓冲零碎相比,可以有较高的区分率。
  稀释胶的作用是有沉积作用,凝胶深浅较小,孔径较大,把较稀的样品加正在稀释胶上,通过大孔径凝胶的迁徙作用而被稀释至一度狭隘的区带。当样品液和稀释胶选TRIS/HCl缓冲液,栅极液选TRIS/甘氨酸。电泳开端后,HCl解离成氯离子,甘氨酸解离出大批的甘氨酸根离子。蛋白胨带负点电荷,因而一同向阳极挪动,内中氯离子最快,甘氨酸根离子最慢,卵白从中。电泳开端时氯离子泳动率最大,超越卵白,因而正在前面构成低电导区,而磁场强度与低电导区成正比,因此发生较高的磁场强度,使卵白和甘氨酸根离子疾速挪动,构成一稳固的界面,使卵白汇集正在挪动界面左近,稀释成一两头层。
  此鉴定办法中,蛋白胨的迁徙率次要起源于它的绝对于成员品质,而与所带点电荷和成员外形有关。
  聚丙烯酰胺凝胶电泳职称为PAGE(Polyacrylamide gel electrophoresis)聚丙烯酰氨凝胶电泳
  聚丙烯酰氨凝胶电泳
  ,是以聚丙烯酰胺凝胶作为支撑介质的一种罕用电泳技能。聚丙烯酰胺凝胶由单体丙烯酰胺和甲叉双丙烯酰胺集合而成,集合进程由自正在基催化实现。催化集合的罕用办法有两种:化学聚非法和光聚非法。化学集合以过硫酸铵(APS)为催化剂,以四甲基乙二胺(TEMED)为减速剂。正在集合进程中,TEMED催化过硫酸铵发生自正在基,后者引发丙烯酰胺单体集合,同声甲叉双丙烯酰胺与丙烯酰胺链间发生甲叉键交联,从而构成三维网状构造。
  依据其有无稀释效应,分成陆续零碎和没有陆续零碎两大类,陆续零碎电泳系统中缓冲液pH值及凝胶深浅相反,带电颗粒正在磁场作用下,次要靠点电荷和成员筛效应。没有陆续零碎中因为缓冲液离子因素,pH,凝胶深浅及洪水位梯度的没有陆续性,带电颗粒正在磁场中泳动没有只有点电荷效应,成员筛效应,还存正在稀释效应,因此其结合条带明晰度及区分率均较前端佳。没有陆续系统由栅极缓冲液、稀释胶及结合胶所组成。稀释胶是由AP催化集合而成的大孔胶,凝胶缓冲液为pH6.7的Tris-HCl。结合胶是由AP催化集合而成的小孔胶,凝胶缓冲液为pH8.9 Tris-HCl。栅极缓冲液是pH8.3 Tris-甘氨酸缓冲液。2种孔径的凝胶、2种缓冲系统、3种pH值使没有陆续系统构成了凝胶孔径、pH值、缓冲液离子因素的没有陆续性,这是样品稀释的次要要素。
  蛋白胨正在聚丙烯酰胺凝胶中电泳时,它的迁徙率起源于它所带净点电荷以及成员的大小和外形等要素。假如退出一种试药使点电荷要素消弭,那电泳迁徙率就起源于成员的大小,就能够用水泳技能内定蛋白胨的成员量。1967年,Shapiro等发觉阴离子清洁剂十二氢氧基硫酸钠(SDS)存正在这种作用。当向蛋白胨滤液中退出剩余量SDS和巯基酒精,可使蛋白胨成员中的二硫键复原。因为十二氢氧基硫酸根带阴电,使各族蛋白胨—SDS化合物都带上相反密度的负点电荷,它的量大大超越了蛋白胨成员原的点电荷量, 因此覆盖了没有同种蛋白胨间原部分点电荷差异,SDS与蛋白胨联合后,还可惹起构象改观,蛋白胨—SDS化合物构成相近“卷烟烟”形的长扁圆棒,没有同蛋白胨的SDS化合物的短轴长短都一样,约为18A(1A=10的负十次方米),那样的蛋白胨—SDS化合物,正在凝胶中的迁徙率,没有再受蛋白胨原的点电荷和外形的反应,而起源于成员量的大小因为蛋白胨——SDS化合物正在部门长短上带有相同的点电荷,因为它们以相同的迁徙进度从稀释胶进入结合胶,进入结合胶后,因为聚丙烯酰胺的成员筛作用,小成员的蛋白胨能够简单的经过凝胶孔径,屏障小,迁徙进度快;大成员蛋白胨则遭到较大的屏障而被滞后,那样蛋白胨正在电泳进程中就会依据其各自成员量的大小而被结合。因此SDS聚丙烯酰胺凝胶电泳能够用来内定蛋白胨的成员量。当成员量正在15KD到200KD之间时,蛋白胨的迁徙率和成员量的对于数呈线性联系,相符下式:logMW=K-bX,式中:MW为成员量,X为迁徙率,k、b均为常数,若将已知成员量的规范蛋白胨的迁徙率对于成员量对于数作图,可失掉一条规范直线,未知蛋白胨正在相反环境下停止电泳,依据它的电泳迁徙率即可正在规范直线上求得成员量。
  ——聚丙烯酰胺凝胶电泳时常使用于裂化进程中纯度的检测,纯化的蛋白胨一般正在SDS电泳上应只要一条带,但假如蛋白胨是由没有同的亚基组成的,它正在电泳中能够会构成辨别对于应于各个亚基的多少条带。SDS——聚丙烯酰胺凝胶电泳存正在较高的锐敏度,正常只要要没有到微克量级的蛋白胨,并且经过电泳还能够同声失去对于于成员量的状况,该署消息关于理解未知卵白及设想裂化进程都是无比主要的。
  ⒈ 配胶缓冲液零碎对于电泳的反应?
  正在SDS——PAGE没有陆续电泳中,制胶缓冲液运用的是Tris——HCL缓冲零碎,稀释胶是pH6.7,结合胶pH8.9;而电泳缓冲液运用的Tris——甘氨酸缓冲零碎。正在稀释胶中,其pH条件呈强酸性,因而甘氨酸解离很少,其正在磁场的作用下,泳动频率低;而CL离子却很高,两者之间构成异质性较低的区带,卵白成员就介于二者之间泳动。因为异质性与磁场强度成正比,这一区带便构成了较高的电压梯度,压着蛋白胨成员汇集到一同,稀释为一狭隘的区带。当样品进入结合胶后,因为胶中pH的增多,呈酸性,甘氨酸少量解离,泳动速率增多,间接紧随氯离子以后,同声因为结合胶孔径的减少,正在磁场的作用下,卵白成员依据其固部分带电性和成员大小停止结合。
  因为,pH对于整个反响系统的反应是至关主要的,试验中正在扫除其余要素以后仍没有能很益处理成绩的状况,应首要思忖该要素,千万其余的要素也能够从多范围思忖。
  ⒉ 样品如何解决?
  依据样品结合手段没有同,次要有三种解决办法:复原SDS解决、非复原SDS解决、带有氢氧基化作用的复原SDS解决。
  复原SDS解决:正在上样buffer中退出SDS和DTT(或者β-巯基酒精)后,蛋白胨构象被解离,点电荷被中和,构成SDS与卵白相联合的成员,正在电泳中,只依据成员量来结合。正常电泳均按这种形式解决,样品浓缩恰当深浅,退出上样Buffer,离心,沸水煮5min,再离心加样。
  带有氢氧基化作用的复原SDS解决:碘醋酸胺的氢氧基化作用能够很好的并经久结实的掩护SH基团,失去较窄的谱带;另碘醋酸胺可捕集适量的DTT,而预防银染时的纹路景象。100ul样品缓冲液中10ul 20%的碘醋酸胺,并正在室温保鲜30min。
  非复原SDS解决:生理月经、血球、尿素等样品,正常只用1%SDS沸水中煮3min,未加复原剂,因此卵白折叠未被毁坏,没有可作为内定成员量来运用。
聚丙烯酰胺凝胶电泳的作用
  ⒊ SDS-PAGE电泳凝胶中各次要因素的作用?
  聚丙烯酰胺的作用:丙烯酰胺与为蛋白胨电泳需要载体,其凝结的是非间接联系到电泳顺利与否,与促凝剂及条件亲密有关;制胶缓冲液:稀释胶取舍pH6.8,结合胶取舍pH8.8,取舍Tris——HCl零碎,TEMED与AP:AP 催化剂,催化单丙和双丙聚分解聚丙烯酰胺。TEMED四甲基乙二胺,催凝剂,减速AP催化作用;十二氢氧基磺酸钠(SDS):阴离子清洁剂,作用有四:去蛋白胨点电荷、解离蛋白胨之间的氢键、取缔卵白成员内的疏水作用、去多肽折叠。
  ⒋ 进步SDS-PAGE电泳区分率的道路?
  聚丙烯酰胺的充足集合,可进步凝胶的区分率。提议做法:待凝胶正在室温凝结后,可正在室温下搁置一段工夫运用。忌即配即用或者4度冰箱搁置,前端易招致凝结没有充足,后者可招致SDS结晶。正常凝胶可正在室温下销毁4天,SDS可电离聚丙烯酰胺。
  正常罕用的有胆固醇黑、考马斯亮蓝、银纺织三种颜料,没有同颜料又各自没有同的纺织办法,详细可参照郭尧君编著的《蛋白胨电泳技能画册》P82-103。
  ⒌“ 浅笑”(两边翘起两头凹下)形带缘由?
  次要是因为凝胶的两头全体凝结没有匀称所致,多涌现于较厚的凝胶中。
  解决方法:待其充足凝结再作后续试验。
  ⒍ “接吻”(两边向下两头鼓起)形带缘由?
  次要涌现正在蛋白胨垂直电泳槽中,正常是两板之间的底部间隙卵泡未扫除腌臜。
  解决方法:可正在两板间退出过量缓冲液,以扫除卵泡。
  ⒎ 干什么带涌现拖尾景象?
  次要是样品融解成效没有佳或者结合胶浓渡过大惹起的。于是能够是灌胶时候离胶过多招致稀释胶很少,没有能起到稀释作用,没有把样品压成一条线。
  解决方法:加样前离心;取舍恰当的样品缓冲液,加过量样品促溶剂;电泳缓冲液工夫过长,从新配制;升高凝胶深浅;灌胶时候离胶没有要过多。
  ⒏ 干什么带涌现纹路景象?
  次要是样品没有溶性颗粒惹起的。
  解决方法:加样前离心;加过量样品促溶剂。
  ⒐ 什么是“鬼带”,如何解决?
  “鬼带”就是正在跑大成员构象简单的蛋白胨成员时,大会涌现正在泳道顶端(有时正在稀释胶中)的一些大成员未知条带或者加样孔底部有积淀,次要因为复原剂正在加热的进程中被氧化而得到活性,以致本来被解离的蛋白胨成员从新折叠联合和亚基从新缔合,聚分解大成员,其成员量要比指标条带大,有时没有能进入结合胶。但它却于指标条带有相反的免疫学活性,正在WB反响中可见其能与指标条带对于应的抗原作用。
  解决方法:正在加热煮沸后,再增添过量的DTT或者Beta巯基酒精,以补充有余的复原剂;或者可加过量EDTA来阻遏复原剂的氧化。
  ⒑ 干什么溴酚蓝没有能起到批示作用?
  咱们正在试验中大会遇到溴酚蓝已跑出板底,但蛋白胨却还未跑上去的景象。次要与缓冲液和结合胶的深浅相关。
  解决方法:改换准确pH值的Buffer;升高结合胶的深浅。
  ⒒ 干什么电泳的条带很粗?
  电泳中条带很粗是罕见的事,次要是未稀释好的缘由。
  解决方法:恰当增多稀释胶的长短;保障稀释胶贮液的pH准确(6.7);恰当升高电压;⒓ 干什么电泳电压很高而直流电却很低呢?
  这种景象正常初鸿儒易涌现。比方电压50v之上,可直流电却正在5mA以次。次要是因为电泳槽没有准确拆卸,直流电未构成电路。囊括:a.里外槽装反;b.外槽液过少;c.电泳槽底部的非导体未去掉(比方倒胶用的橡胶皮)。
  解决方法:电泳槽准确拆卸即可。
  ⒔ 稀释胶与结合胶折断、板间有卵泡对于电泳有反应吗?
  这次要涌现正在初鸿儒中,正常对于电泳没有会有太大的反应。前端次要缘由是拔篦子使劲没有匀称或者过猛所致;后者是因为正在消除制胶的夹子后,板未压紧而致气氛进入惹起的。
  ⒕ 凝胶工夫没有对于,或者慢或者快,怎样回事?
  一般胶正在30MIN-1H内凝。假如凝的太慢,能够是TEMED,APS剂量没有够或者许生效。APS该当现配现用,TEMED没有稳固,易被氧化成黄色。假如凝的太快,能够是APS和TEMED用量过多,这时胶太硬易裂,电泳时易烧胶。
  ⒖ 电泳工夫比畸形要长?
  能够因为凝胶缓冲零碎和电级缓冲零碎地PH取舍谬误,即缓冲零碎地PH和被结合精神的等电点差异太小,或者缓冲零碎的离子强度太高。
  ⒗结合胶加上后干什么要即时加水?
  退出结合胶后,即时覆一层双蒸水,一是为了使结合胶界面维持程度,用电就能够把它压平,使蛋白胨成员跑时正在同一程度线上;二是阻遏气氛中的氧气对于凝胶集合的抑止造用。
  ⒘陆续结合胶系统配制(凝胶板薄厚0.75mm,长短10cm)100ml系统:双蒸水尿 素
  ×TBE缓冲液
  丙烯酰胺
  (过硫酸铵)500--800ul [注:现配现用
  (四甲基乙二胺)
  聚丙烯酰胺凝胶是由丙烯酰胺单体(当前职称单体)正在水滤液中集合而成的亲医道高聚物,是一种通明而没有溶于水并有韧性的凝胶。
  制备凝胶时需求的原料药是:丙烯酰胺,亚甲基双丙烯酰胺(双体,用作交联剂)o正在水滤液顶用催化剂引发集合。罕用的催化剂有:二甲胆固醇丙腈(DMAPN);过硫酸铵,四甲基乙二胺;过硫酸铵或者加核黄素后用紫外线(跨度253.7毫丝米)引发集合。
  集合时丙烯酰胺成员经过加成反响构成长链,双体的作用是正在长链之间构成交联,变化存正在三维网状构造的凝胶(见图1)。因为正在凝胶电泳中除非存正在电泳的结合外还存正在成员筛作用,从而提高了它的区分威力。
  集合时,依据结合的需求,能够用改观单体滤液深浅或者增减双体对比的方法酿成孔度大小没有同的凝胶。正在结合血球卵白时,咱们采纳的丙烯酰胺总深浅为6.5%,内含单体96%,双休4 5{刍(T一6.5,c一4%)。
  集合物成员中含有很多酰胺基,因为凝胶存正在优良的亲医道,能正在水中溶胀但没有溶化。
  一。设施
  停止凝胶电泳的安装见图版4。
  电流源假如一次停止电泳的管数正在20管以内能够用最大直流电300毫安的整组器(硅或者硒整组器),调压范畴0—300伏。
  电泳安装囊括二个缓冲液槽和电泳 管。液槽能够用玻璃或者塑料酿成,正在底部钻孔。拔出电泳管,用有孔镇纸塞流动。电泳管选用孔径匀称分歧的玻璃管切制。长10厘米,内径 ^5毫米。脱色用玻璃管长10厘米,内径8毫米。底部稍拉尖,用半透膜及镇纸陷阱住底部。
  )凝胶管架灌装凝胶管时使管维持垂直地位,用无机玻璃酿成。
  二。操作办法
  )凝胶管的制备将电泳玻管用小镇纸塞塞住底部,而后灌入新配的凝胶滤液(办法见上文)。每管加至固体高低为7.5厘米。为了保障凝胶名义平坦可用打针器经过细针头不慎肠加一层(高约1厘米)醇化水于名义上,勿使与凝胶液混合,室温搁置。假如环境适合滤液于 30—60秒钟内集合而成凝胶。凝胶滤液的配制办法如次:滤液甲:丙烯酰胺(氯仿重结晶)25克,双体(丙醇重结晶)1克,加水配成100毫升滤液。多余时用三羟甲基胆固醇烷烃调pH至7.0。滤液乙:二甲胆固醇丙腈l毫升,三羟甲基胆固醇烷烃0.85克(也可用0.625克氨三酒精或者氨酒精)加水至100毫升。滤液丙:K3Fe(cN)6综合纯0.075克,加水至100毫升新配。用作阻聚剂以延缓凝结工夫。使操作便当,如凝结工夫已剩余长能够用醇化水接替。滤液丁:过硫酸铵(二级)2.8克加水至 100毫升新配。多余时用氢氧化铵调pH至7.0 c, 滤液甲及乙配后可正在冰箱中销毁数月。滤液丙及丁用时新配。临用前将滤液甲、乙、丙、丁等量混合。
  预备把已灌装凝胶的玻管经过有孔椽皮塞装置正在下面液槽的底孔中,正在高低两槽内辨别注入缓冲液。装上后电泳管下端应淹没正在下槽的缓冲液中,管下端勿留卵泡。血球电泳能够用巴比妥缓冲液pH一8.6,离子强度0.05(配法:巴比妥钠10.3克,二乙基巴比土酸1.84克,加水至1升,温热使溶。加硫柳汞0.1克防霉)。
  加样正在材料引见的办法中,正常还正在了这一步。正在血球样品中退出大批蔗糖以增多密度,用血红蛋白吸管间接不慎肠加正在凝胶名义上,加样量正常为7微升血球。假如正在样品中混进大批溴酚兰批示剂就能够正在电泳进程中视察前沿挪动的状况。
  电泳正在二液槽中安放铂金丝栅极;阳极正在下,阴极正在上。接回电源停止电泳,磁场强度10伏/厘米内外,视室温上下而定。室温较高时宜用较低的电压免得发烧适度反应结合。蛋白胨向阳极挪动。侍颜料前沿挪动至管底近处,中止直流电。电泳工夫为1一2时辰。电泳终了取下凝胶管,用修长针头沿管壁注醇化水,使凝胶与管壁剥开。而后用镇纸球压出凝胶条。
  纺织及脱色电泳后的凝胶条正在1%胆固醇黑10B正在7%乙酸滤液上流动并纺织1时辰之上。纺织后的凝胶条用7%乙酸洗濯数次。置于脱色玻管中,正在同一电泳安装中电开脱色。这时改用7%乙酸充装正在液槽中。回电后过剩凝胶以上再加一层大孔凝胶,样品集合正在最初的另一层凝胶中(图2)。正在咱们的实验中省略的颜料泳向阳极。脱色时磁场强度25伏/厘米,直流电10—1 5毫安/管。3—4时辰脱色终了。提高电压能够减速脱色。有色的乙酸滤液经过盛有骨炭的漏子过滤,即可除了颜料,从新运用。
  销毁与记载脱色后的凝胶能够装正在盛有7%乙酸的有塞滴管中销毁数年。也能够做作枯燥后销毁,正在需求视察时再浸正在7%乙酸中溶胀利润来外形。记载能够用照相放映。也能够用光密度计停止捕记。光密度计的区分力决议于其狭缝宽窄及光电管缩小折扣。
  三、试验后果
  .电泳环境的取舍
  为了取舍血球卵白电泳较适合的环境,咱们辨别对于单体深浅、双体深浅、配制凝胶时所用没有同阳离子、各族电压、二甲胆固醇丙腈的深浅、过硫酸铵的深浅等环境停止了实验。依据之上实验后果,咱们正在结合血球卵白时选用的环境是:单体深浅6.25-6.5%,双体占总丙烯酰胺量的4—5%,阳离子采纳三羟甲基胆固醇烷烃,二甲胆固醇丙腈及过硫酸铵深浅辨别为0.25%及0.7%。电泳电压以7—10伏/厘米较为适合。但电泳工夫较长,约2—3时辰,室温低时能够电压稍高。假如室温较高则能够正在冰箱中停止电泳。
  .人血球及其石油分划全体的凝胶电泳
  采纳上述环境咱们停止了畸形人血球的凝胶电泳。正常能够分红15—20条区带。咱们也依据RaFmand引见的两向电泳办法比拟了纸电泳和凝胶电泳各区带的绝对于联系。纸电泳上的a:区带正在凝胶电泳中可被结合成10条之上区带。但纸电泳中d,区带的一全体则与凝胶电泳中自卵白区带相重合。二种电泳办法所得的图谱见图版9。正在畸形人血球中后白蚤白(PA)、转铁卵白(Tr)和触珠卵白(HP)均有没有同的型, 一例经络瘤患者血球的和凝胶电泳自正在电泳图谱的比拟见图版11、12。咱们也比拟了石油分划人血浆各全体的纸电泳和凝胶电泳图谱,后果见图版13。从图中可见正在纸上电泳检定计看来较纯晦白卵白和丙种球卵白全体,正在凝胶电泳中可见显然的其余卵白区带。
聚丙烯酰胺凝胶电泳的作用
  .喷射病狗血球卵白电泳的视察 喷射病植物血球卵白的改观能够正在纸电泳中视察到。正常以为狗正在照耀后吻球卵白有提高。用凝胶电泳视察能够失去更深化的资 料。畸形狗血球的凝胶电泳图谱大体与人相 似。狗受致死量照耀后第九天有明 显变迁,至极期时则能够视察到鸭、Tr、融及 sp等区带有显然提高。咱们用胎3—10型光 谱仪用光密度计将电泳图谱停止了扫描,所得 后果见图3,图版14。因为仪表的制约光缝 最小只能到达0.5毫米,从而反应了其区分力。但与畸形血球比照能够见到其改观的状况,这 远比纸电泳中所见更为显然。咱们以为假如联 系临床体现对于变迁的性质停止一些钻研,将有 助于理解喷射病极期离开始终体内蛋白胨新陈代谢的一些状况。
  .正在结合畸形人尿DNase时的凝胶电泳 视察 用葡聚糖凝胶结合人尿中DNase时能够除了大全体其余蛋白胨和杂质。但结合所得的制品用凝胶电泳视察还能够见到五条之上的蛋白胨区带(见图版14)。将凝胶条正在未纺织前置于含大成员DNA的琼脂呆滞上,正在37c‘温箱中保鲜2—3时辰,再用5%三氯乙酸加至如此解决过的琼脂板上,能够看到乳红色本底上涌现被酶电离后的通明斑点。将凝胶条用氨黑纺织后显现其卵白区带的地位。二者比拟就能够肯定存正在酶活性的因素的呼应电泳地位。咱们的实验中视察到人尿DNase正在凝胶电泳中至多被结合成二条之上有酶活性的区带。注明有同功酶的能够。使用这一办法能够较深人地视察月经中酶的状况。同声也注明能够用凝胶电泳来批示生物药剂制备进程中纯化的状况。
  四、结 论
  白文引见了聚丙烯酰胺凝胶电泳的一些初步试验环境和试验后果,并与纸电泳、自正在电泳等停止了比照。从后果中能够看到聚丙烯酰胺凝胶电泳的区分力较强,重演性优良。它正在临床理化综合及生物活性精神的结合、制备中和纯度鉴定中存正在较宽泛使用的能够性。