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聚合物降解菌的分离筛选及鉴定

发布日期:2015-03-05 17:36:11
聚合物降解菌的分离筛选及鉴定
聚合物降解菌的分离筛选及鉴定,聚丙烯酰胺是一种高分子量的聚合物,常规菌种降解难度很大。本研究通过采自聚 合物含量高的陕北油田地区的泥浆池废液和周边土壤中的样品,分离筛选对聚丙烯酰胺 环境有高度适应能力和对聚合物有降解潜力的菌株,并对最终得到目标菌种进行分离鉴 定。
1实验材料
1.1菌种来源
菌种由陕西长庆43-1号油田泥浆池废液和4-23号油田废弃泥浆池周围土壤中分别分
离筛选得到。 1.2主要试剂与仪器
主要试剂列表如下:
表2-1主要实验试剂 Table2-1 Main Reagents
试剂名称生产公司
蛋白酶K西安润德生物技术有限公司
RNaseA西安润德生物技术有限公司
三(羟甲基)胺基甲烷(Tris)西安市雁塔区保昕化学试剂有限公司
十六烷基三甲基溴化胺(CTAB)陕西昕泰生物科技发展有限公司
十二烷基硫酸钠(SDS)西安润德生物技术有限公司
聚乙烯聚吡咯烷酮(PVPP)西安永屹生物技术有限公司
Tris饱和酚上海索莱宝生物科技有限公司
溴化乙锭i:EB)西安国安生物科技有限公司
其它试剂:氯化钠、乙酸钠、EDTA、氯仿、异戊醇、异丙醇、乙醇等,均为分析 纯。
主要仪器列表如下:
表2-2主要实验仪器 Table2-2 Main experimental apparatus
仪器名称生产公司
SartoriusBS210S 电子天平北尕赛文利斯天平有限公司
Eclipse E200 显微镜曰本尼康公司
显微摄像系统日本尼康公司
LDZX-40BI立式压力蒸汽灭菌锅上海申安医疗器械厂
GZX-DH400-BS-II电热恒温干燥箱上海跃进医疗器械厂
SXK-103超净工作台安徽蚌埠净化设备厂
DNP-9052细菌培养箱上海跃进医疗器械厂
ZHWY-A211C卧式旋转型摇床上海智城分析仪器制造有限公司
SPX-250IC人工气候箱上海博迅实业有限公司
PYX-DHS-35X40隔水式电热恒温培养箱上海市跃进医疗器械厂
手持式土壤PH测试仪广州铭睿电子土壤酸度计
土壤水份测定伩哈尔滨宇达电子技术有限公司销售部
1.3培养基
菌种筛选培养基。其组成如下:乳酸钠4ml,KH2P040.02g,聚合物降解菌的分离筛选及鉴定,NaCl 10g, MgS04 *7^0 为0.2g,维生素C0.2g,酵母膏l.Og,模拟水为1000ml的lg/LHPAM。灭菌冷却后加 入经紫外灭菌的FeS04(NH4)2S04 • 6H20。
实验用部分水解聚丙烯酰胺分子量1.7-2.2X107,水解度18.6-29.3%,高效pH范围 4-13,固含量之90%,残单0.05-0.15%,白色颗粒粉末,由巩义市拓普净水材料有限公司 提供。
富集培养基:在菌种筛选培养基中分别加0.1%酵母膏和0.1%蛋白胨,用于菌株的 平板培养和斜面保存。
细菌分离及斜面培养基:蛋白胨l〇g,牛肉膏4.5g,氯化钠5g,琼脂20g,蒸馏水 lOOOmL, pH 值 7.2〜7.5。
真菌分离及斜面培养基(PDA培养基):马铃薯200g煮出液,蔗糖20g,琼脂15〜20g, 蒸馏水1000 mL, pH值自然。
2实验方法
2.1菌株的富集
实验样品采自陕西长庆43-1号油田泥浆池废液周围土壤和4-23号油田废弃泥浆池 周围土壤的共4处采样点。采样方法:用小铁锹除去地面浮土后,取地表或地下10 cm 的土壤样品,置于-2(TC保存。
表2-3采集土壤特性
Table2-3 Collected soil characteristics
编号PH含水率
43-1号采样点18.558.3%
43-1号采样点28.898.5%
4-23号采样点18.3715.1%
4-23号采样点28.2115.6%
将所采集的HPAM污染土样称量10g,接入200mL已灭菌的富集液体培养基中, 在30°C旋转式摇床中(转速200 r/min)旋转培养4d后,移取一定量含菌的富集培养液接 入新鲜灭菌过的富集培养基中,在相同条件下培养4d,一共重复3次,得到富集的HPAM 降解混合菌。
2. 2菌株的筛选
取O.lmL菌液涂布于以HPAM为唯一碳源的筛选培养基上,30°C培养48h,待平板 长出菌落后选择生长良好且性状差异明显的菌落,连续平板划线纯化,将纯化的菌株转 接于筛选养基斜面培养Id后4"C保存于冰箱。
2. 3形态鉴定
根据《Bergey’s Manual of Determinative Bacteriology》(Buchanan R.E. and Bergey N.E., 1994)和《常见细菌系统鉴定手册》(东秀珠和蔡妙英,2001)的方法,进行各菌株 的形态鉴定,包括细菌个体形态观察(革兰氏染色、芽孢染色和菌体大小等)和菌落形态 观察(菌落形态、菌落质地、菌落边缘、光学特性和菌落的颜色等)。
2. 4菌株的常规生理生化性质测定
挑取筛选到的菌株分别接入筛选养基中,在温度30°C、转速200 r/min的旋转式摇 床中摇瓶培养4d后,将得到的菌液在筛选养基平板上划线,并在30°C的细菌培养箱中 培养活化l-2d。选择活化良好的菌株作为实验菌株,参照《简明第八版伯杰细菌鉴定手 册》[48]《常见细菌系统鉴定手册》[49]对筛选的细菌进行生理生化性质测定,将细菌初步 鉴定到属。鉴定方法主要有革兰氏染色法、芽孢染色法、V-P实验、葡萄糖氧化发酵实 验、淀粉水解试验、甲基红试验、接触酶试验、明胶液化、半固体琼脂穿刺、细菌的运 动性观察、硫化氢反应等,各实验均重复3次。具体实验方法如下:
(1)革兰氏染色:挑取少量菌苔涂布在载玻片上,风千,在火焰上固定涂片,滴加结 晶紫染色1-2 min,水洗,滴加碘液冲去残水,并用碘液覆盖约1 min,水洗。用滤纸吸 去载玻片上的残水,将玻片倾斜,在白色背景下,用95%的乙醇脱色,直至流出的乙醇 无紫色时,立即水洗。用番红液复染约2 min,水洗。干燥后,用油镜观察。菌体被染 成蓝紫色的为革兰氏阳性菌,被染成红色的为革兰氏阴性菌。
(2)芽孢染色:加1-2滴水于小试管中,用接种环挑取2-3环菌苔于试管中,搅拌均匀, 制成浓的菌悬液。加孔雀绿染液2-3滴于小试管中,并使其与菌液混合均匀,然后将试 管置于沸水浴的烧杯中,加热染色15-20 min。用接种环挑取试管底部菌液数环于洁净 载玻片上,涂成薄膜,然后将涂片通过火焰3次温热固定。水洗,直至流出的水无绿色 为止。用番红染液染色2-3 min,倾去染液并用滤纸吸干残液。干燥后用油镜观察。芽 孢呈绿色,芽孢囊及营养体为红色。
(3)尿素酶(Urease)试验:挑取培养了 18~24h的待试菌培养物接种于液体培养基管 中,摇均,于36°C各培养lOmin,60min和120min,分别观察结果。若结果为粉红色为、 则呈阳性。
(4)氧化酶(Oxidase)试验:在琼脂斜面上滴加试剂1〜2滴,数分钟内直接观察结果。 使用Kovacs氏试剂阳性者呈粉红色或深紫色,Ewing氏改进试剂呈蓝色。
(5)过氧化氢酶的测定:将测试菌种接种于合适的培养基斜面上,适温培养18〜24h。 取一干净的载波片,在上面滴1滴3〜10%的H202,挑取1环培养了 18〜24h的菌苔纯培 养,在H202溶液中涂抹,若有气泡出现,则为过氧化氢酶阳性,无气泡者为阴性。
(6)甲基红(Methyl Red)试验:挑取新的待试纯培养物少许,接种于MR-VP生化 鉴定管,在通用培养基30°C下培养3〜5天,从第二天起,每日取培养液lml,加入甲基 红指示剂1〜2滴,观察结果。阳性呈鲜红色,弱阳性呈淡红色,阴性为黄色。从发现阳 性开始到第5天仍为阴性的,即可判定结果。
(7)V-P试验:将实验菌接种于通用培养基于36°C培养48h,培养液lml加O’Meara 试剂lml,摇动试管1〜2min,静置于36°C恒温箱,若4h内不呈现伊红的红色即判定为 阴性,聚合物降解菌的分离筛选及鉴定,反之为阳性。
(8)葡萄糖的氧化发酵试验:以培养18〜24h的幼龄菌种,穿刺接种在基础培养基中, 每株菌接4管,其中2管用油封盖,以隔绝空气闭管。另2管不封油为开管,同时留有 不接种的闭管作为对照。适温培养1、2、4、7天观察结果。氧化型产酸:仅开管产酸。 发酵型产酸:开管及闭管均产酸。如产气,则在琼脂柱内产生气泡。
(9)硝酸盐(Nitrate)还原试验:临试前将试剂磺胺酸冰醋酸溶液和试液a —萘胺乙醇 溶液各0.2ml等量混合,取混合试剂约0.1ml,加于液体培养基或琼脂斜面培养物表面, 立即或于lOmin内呈现红色即为试验阳性,若无红色出现则为阴性。
(10)靛基质(Imdole)试验:将待测菌种接种于试验培养基管,于36°C培养24h时后, 先加少量乙醚或二甲苯,摇动试管以提取和浓缩靛基质,待其浮于培养液表面后,再沿 试管壁徐徐加入Kovacs氏试剂数滴,观察结果。若在试剂和培养基接触面上呈红色, 即为阳性。
(11)三糖铁(TSI)琼脂试验:以接种针挑取待试菌可疑菌落或纯培养物,穿刺接种 并涂布于斜面,置36°C培养18〜24h,观察结果。
(12)氨基酸脱羧酶的测定:用幼龄培养液作为菌种,直接接种。接种后封油,对照管 与测定管同时接种封油。肠肝菌科的细菌于37°C培养4天观察。当指示剂呈紫色或带红 色调的紫色者为阳性,呈黄色者为阴性。对照管应呈黄色反应。
(13)硫化氢(H2S)试验.•在含有硫代硫酸钠指示剂的培养基中,沿管壁穿刺接种于 36C培养24~28h,培养基呈黑色为阳性。阴性应继续培养至6天再观察结果。
(14)柠檬酸盐或丙酸盐的利用:取幼龄菌种接种于斜面上,适温培养3〜7天,培养基 呈碱性(蓝色)者为阳性反应,不变者则为阴性。
(15)葡萄糖酸盐的氧化:用pH7.2的磷酸缓冲液配制成含1%葡萄糖酸盐的溶液,分 装试管,每管2mL。挑取30°C温培养的18~24h的菌落至2mL的葡萄糖酸盐溶液中制 成浓的菌悬液,置30°C过夜。每管加入0.5mL的斐林试剂,放在沸水浴中加热10分钟, 观察结果。试管中液体由蓝色变为黄绿,绿橙色或出现红色沉淀者为阳性反应,如溶液 不变色者为阴性。
(16)耐盐性试验:以肉汤培养液根据鉴定需要,配成不同浓度的NaCl,如2%、3.5%、 5%、7%、10%等。培养基要求十分澄清,接种时应采用幼龄菌液,直针接种,适温培 养3〜7d,与未接种的对照管对比,目测生长情况。
(17)酪素水解试验(酪蛋白水解):取5g脱脂奶粉加入50mL蒸馏水中,称1.5g琼脂 溶于50mL蒸馏水中,将两液分开灭菌。稍冷却后将两液混匀倒平板,即成牛奶平板。 将平板倒置过夜后将菌种点接在平板上。适温培养1、3、5天,观察结果,记录菌落周
围和下面酪素是否已被分解而呈透明。
(18)苯丙氨酸脱氨试验:将菌种接种于该培养基斜面上,30°C下温培养3〜7d。取10% 的FeCl3水溶液4滴,滴加在生长菌苔的斜面上,当斜面和试剂液面处呈蓝绿色时则为 阳性反应。
(19)产糊精结晶试验:在大试管中装碾过的小麦0.5g,碳酸钙0.2g, H20 10mL,灭 菌后接种,35°C培养3d、5d和7d后,取1滴卢哥尔氏捵液混匀,干燥后,用显微镜观 察有暗褐色或蓝色的六角形结晶的糊精,假若大量形成,则排列为扇形或针状。
(20)在pH5.7营养肉汤上的生长:取菌液一环,接种于上述培养基中,同时接种普通 肉汤液(7.2pH)作对照。适温培养1〜3d后观察生长情况。
(21)需氧性试验:用接种环挑取一环肉汤菌液,穿刺接种到基础培养基中,30°C培养, 在3至7天观察结果。如细菌在琼脂柱表面上生长者为好氧菌,如沿着穿刺线上生长者 为厌氧菌或兼性厌氧菌。
(22)淀粉水解试验:待测菌种培养18〜24h得到纯培养物,涂布接种于淀粉琼脂平板, 于36°C培养24~48h,然后将碘试剂直接滴浸于培养表面,立即检视结果,阳性反应时 淀粉被分解,琼脂培养基呈深蓝色、菌落或培养物周围出现无色透明环、或肉汤颜色无 变化。阴性反应则无透明环或肉汤呈深蓝色。
(23)生长温度的测定:放置于恒温水浴培养。聚合物降解菌的分离筛选及鉴定,指示温度计应放在同样的试管和培养基 内,在指定温度下培养2〜5d,观察生长情况。在接近0°C的低温培养,则观察时间可延 长至7~10山甚至30d#目测生长情况,与未接种的空白培养基对比,注意混浊度、沉 淀物和悬浮物等项。
(24)形成芽孢的培养基形成芽孢是芽孢杆菌的关键性特征,但不是所有的芽孢杆菌都 能在任何条件下形成芽孢。在鉴定细菌时,为了确定是否属芽孢菌,需要对那些在一般 条件下不形成芽孢的细菌,采用生孢子培养基,来确定是否能形成芽孢。
3实验结果及讨论
3.1菌株的分离筛选形态鉴定结果
经过富集培养基富集,对目标菌株进行分离、纯化,共得到2株具有降解HPAM潜 能的菌株。
陕西长庆43-1号油田泥浆池废液中分离的菌种如图1所示,命名为CJ419。革兰氏 染色为阴性,菌株细胞呈小杆状,可运动;在牛肉膏蛋白胨培养基上为乳白色菌落,光 滑。
4*23号油田泥浆池废液中富集分离的菌种如图2所示,命名为FA16。革兰氏染色为 阳性,菌体为短杆状,在牛肉膏蛋白胨培养基上为白色菌落,菌落不规则生长、表面有
褶皱.
3. 2面株的生理生化性质鉴定结果
依据《Bergey’s Manual of Determinative Bacteriology》和 < 常见细菌系统鉴定手册》, 对菌株CJ419和FA16的分别进行吲哚试验、接触酶反应等生理生化特征鉴定,结果见 表24。
表24拮抗菌株CJ419和FA16生理生化特征 Table 2-4 Antagonistic strains CJ419 and FA16 physiological and biochemical characteristics
项目菌株CJ419项目菌株FA16
严格好氧+鞭毛数>1
过氧化氢酶+荧光色素-
硝酸盐还原+在4。<:生长+
淀粉水解+在41°C生长-
吲哚产生-从蔗糖产生果聚糖+
H2S产生-精氨酸双水解酶+
酪素水解+氧化酶反应+
柠檬酸盐利用+反硝化+
pH5.7营养肉汤+明胶水解+
V.P试验+淀粉水解■
温度45 °C+葡萄糖
利用+
温度65 °C■海藻糖+
葡萄糖产酸+L-脯氨酸+
乳糖产酸6•苯丙氨酸+
甘露醇产酸 葡萄糖产气 10%NaCl+
+DL-精氨酸+
由表2>4可知,菌株FA16的生理生化特征与假单胞菌标准株保持一致。通过查阅 《Bergey’s Manual of Determinative Bacteriology》和《常见细菌系统鉴定手册》,聚合物降解菌的分离筛选及鉴定,综合菌 株形态特征和生理生化特征,可初步确定菌株属于假单胞菌
菌株CJ419的生理生化特征与枯草芽孢杆菌标准菌株保持一致。综合菌株形态特征 和生理生化特征,通过查阅相关鉴定手册,可初步确定菌株属于芽孢杆菌(Bacillus spp.)。
4小结
(1)从聚合物含量很高的陕西长庆43-1号油田泥浆池废液和4-23号油田废弃泥浆 池周围土壤中采样,将所采集的HPAM污染土样富集培养基,连续传代得到富集的 HPAM降解混合菌。取菌液涂布于以HPAM为唯一碳源的筛选养基上,选择生长良好 的性状差异明显的菌落,连续平板划线纯化,通过对样品的筛选得到对聚丙烯酰胺有高 度适应能力和降解能力的两株菌株,分别命名为CJ419和FA16。
(2)对两菌株进行宏观形态和显微鉴定、生理生化鉴定,依据《Bergey’s Manual of Determinative Bacteriology》和《常见细菌系统鉴定手册》,最终初步确定CJ419为假单 胞菌FA16 为枯草芽孢杆菌 。
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